在地下水除鐵除錳過程中，pH值是影響鐵錳去除的關鍵因素。pH值越高，Fe2+和Mn2+的氧化速度越快，鐵錳的去除就越容易。因此不管是通過強曝氣散除CO2的空氣自然氧化除鐵錳工藝，都是采用改變pH值的堿化除鐵除錳工藝，都是采用改變pH值來加快鐵錳的氧化速度。
pH值小于5.5時二價鐵的氧化速度很低；pH值大于5.5時，pH值每升高1.0，Fe2+的氧化反應速度增大100倍。在pH值大于7.5時，亞鐵的氧化速度已經大大加快，原水在混合池中停留不到1min的時間內亞鐵就已將被氧化為三價鐵，使進水變為桔黃色，然后以氫氧化鐵絮體的形式進入濾層，完全依靠濾層的截留能力而不是接觸氧化能力去除，由于氫氧化鐵絮體體積較小，容易穿透濾層，所以出水的總鐵含量有所超標。此時，除鐵的工藝已經由接觸氧化除鐵工藝轉變為堿化空氣氧化除鐵工藝。
中性條件下Mn2+離子的化學氧化反應速率非常緩慢，在pH值大于9.0時才會明顯加快。但地下水的pH值一般不會超過8.0，因此錳的去除需要有催化作用加快其氧化速率。
在接觸氧化除鐵工藝中，曝氣后待濾水的pH值需要達到7.5以上，才能保證錳的順利去除。這對于我國北方原水pH值就已經達到6.8~7.0的地下水而言，曝氣后比較容易滿足pH值的要求。但是相對于南方的地下水一般偏酸性的情況而言，則難以滿足。
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